三、預防接種
嬰兒出生滿24小時以後，即接種人生第１劑疫苗「卡介苗」，２天後例行性接種Ｂ型肝炎疫苗３劑，滿２個月接種現在市面很夯五合一（白喉破傷風非細胞性百日咳、 b 型嗜血桿菌及不活化小兒麻痺）疫苗４劑、出生滿12個月接種麻疹腮腺炎德國麻疹混合疫苗、水痘疫苗、出生滿１年３個月於夏季接種日本腦炎疫苗３劑，共17針劑，共預防12種傳染病。
寶寶在不同成長階段需搭配接種不同疫苗，本縣轄區衛生所統一在每星期二門診免費接種，家長須攜帶兒童健康手冊及健保 I C 卡。若民眾時間上無法配合，本縣與轄區105家醫療院所簽訂預防接種合約以便民，每次酌收150元以下診查費。預防接種合約醫院登在彰化縣衛生局網站－衛生資源－防疫類提供查詢。
少子化是一場寧靜革命，卓縣長認為地方政府必須優先耕耘嬰幼兒健康照護優質服務。提高對嬰幼兒健康照護管理品質的作法包括以下幾個層面：
一、新生兒篩檢
依照衛生統計資料顯示，先天性異常是新生兒及嬰兒的主要死因，為預防遺傳疾病威脅下一代的生命及健康，行政院衛生署自民國73年起，每個寶寶出生後48小時由醫療院所對新生兒採取少許的腳跟血液，寄交行政院衛生署國民健康局指定的新生兒篩檢中心進行相關檢驗，簡稱新生兒篩檢。
過去國內新生兒篩檢項目僅包含指定項目五項-苯酮尿症（PKU）、高胱胺酸尿症（HCU）、半乳糖血症（GAL）、先天性甲狀腺低能症（CHT）及葡萄糖六磷酸鹽去氫?缺乏症（G6PD deficiency）。政府為提供更完善的新生兒篩檢服務，95年7月起增加6項採用串聯質譜儀檢驗先天性代謝異常疾病，篩檢項目累計11項。
二、嬰幼兒健康照護
為維護0-3歲嬰幼兒健康，本縣各鄉鎮市區衛生所開辦優質健兒門診，另延展幼童健診，提供4-6歲幼托園所小朋友「玩遊戲做篩檢」兒童預防保健服務及發展篩檢推動外展模式計畫，以期早期發現異常早期通報及治療。